
Zu Beginn des 13. Jahrhunderts wurde Zentralasien von verheerenden Mongoleninvasionen heimgesucht. Unter dem Befehl von Dschingis Khan wurden ganze Städte dem Erdboden gleichgemacht und ihre Bewohner gnadenlos abgeschlachtet. Dieses katastrophale Ereignis brachte eine jahrtausendealte Zivilisation an den Rand der Zerstörung.
Die für ihre Voraussicht bekannten Sufi-Meister sahen der drohenden Katastrophe und ihren Folgen entgegen. Sie beschlossen, ihre Bemühungen auf drei verschiedene Fronten zu konzentrieren, eine Strategie, die sie sowohl damals als auch heute noch anwenden. Die erste Gruppe von Sufis wanderte in von den Invasionen verschonte Gebiete aus, wo die Lehren in günstigeren Bedingungen bewahrt werden konnten. So zog beispielsweise Jalaluddin Rumis Vater mit seiner Familie von Balkh nach Konya, während der Dichter Saadi nach Bagdad zog, das damals noch relativ sicher war.
Die zweite Gruppe von Sufis blieb zurück, um den Invasoren Widerstand zu leisten. Während der Verteidigung von Choresmien wurde der verehrte Sufi Najmuddin Kubra getötet und Fariduddin Attar starb durch die Mongolen, obwohl er seine Schüler zuvor an sicherere Orte geschickt hatte.
Die dritte Gruppe blieb in den besetzten Städten, um die Aktionen der Eroberer subtil zu lenken und das Erbe und den Einfluss der Sufis zu bewahren und zu stärken, wo immer dies möglich war.
Durch göttlichen Willen war Buchara dazu bestimmt, eines der Heiligtümer zu sein, in denen Zivilisation und spirituelle Lehren geschützt werden konnten. Einigen Quellen zufolge war diese Bewahrung in hohem Maße der Weitsicht der Meister des Khojagan zu verdanken. Kurz vor seinem Tod rief Khoja Abdul-Khalik Gijduvani seine beiden engsten Schüler, Khoja Ali und Khoja Arif Revgari, zusammen und wies sie an, alle Mitglieder des Khojagan zu überreden, nach Buchara umzuziehen.
Khoja Arif Revgari, damals noch relativ jung, übernahm die Führung des Khojagan und behielt diese Rolle während der mongolischen Invasion. Geboren und aufgewachsen in der Nähe von Buchara, im Dorf Revgari, erzählt eine beliebte Legende, dass Dschingis Khan durch dieses Dorf kam, bevor er Buchara belagerte. Die meisten Dorfbewohner flohen voller Angst, aber Khoja Arif blieb ruhig an seinem Webstuhl und arbeitete ungestört. Dschingis Khan, erstaunt über seine Ruhe und sein Können, fragte, wie er es schaffte, so gelassen zu bleiben. Khoja Arif antwortete: „Meine äußere Aufmerksamkeit ist auf meine Arbeit gerichtet, während meine innere Aufmerksamkeit der Wahrheit gilt. Ich verschwende keine Energie darauf, mir Sorgen darüber zu machen, was um mich herum geschieht.„Dschingis Khan war von dieser Antwort beeindruckt und befahl, das Dorf zu verschonen, und bat sogar Khoja Arif, ihn nach Buchara zu begleiten.
Obwohl der Wahrheitsgehalt dieser Legende nicht bestätigt werden kann, ist es wahr, dass Buchara dem Schicksal von Samarkand entging, wo fast alle Einwohner ausgelöscht wurden. Es ist wahrscheinlich, dass Khoja Arif Revgaris Fürsprache und Überzeugungsarbeit eine entscheidende Rolle bei der Rettung zahlloser Leben in Buchara gespielt haben. Die Bevölkerung der Stadt wurde zunächst zur Evakuierung aufgefordert, aber als der Winter nahte, soll Khoja Arif Dschingis Khan überredet haben, Gnade walten zu lassen und den Menschen die Rückkehr zu erlauben. Dschingis Khan respektierte und fürchtete Personen mit außergewöhnlicher spiritueller Kraft, ähnlich wie Schamanen, was seine Entscheidung beeinflusst haben könnte. Dank des strategischen Ansatzes der Khojagan-Meister, die versuchten, Beziehungen zu Menschen aller Rassen und Glaubensrichtungen aufzubauen, kehrte in Buchara viel schneller als in anderen Städten ein normales Leben zurück.