Azerbaiyán está reconocido constitucionalmente como un estado laico, lo que garantiza una clara separación entre los asuntos religiosos y gubernamentales. Este marco único permite la coexistencia de diversas creencias religiosas en el país, lo que refleja su rica diversidad étnica. A pesar de este pluralismo, el chiismo sigue siendo la fe predominante entre la población.
El panorama religioso de Azerbaiyán cuenta con un profundo legado histórico. En el primer milenio a. C., el zoroastrismo floreció bajo el dominio de los imperios aqueménida y sasánida, y sirvió como religión estatal del Imperio persa, del que Azerbaiyán formaba parte. Incluso hoy, muchos lugareños se identifican con elementos del zoroastrismo, y una de las festividades más queridas, Novruz Bayrami, se celebra con gran reverencia.
El islam es la religión principal en Azerbaiyán, con aproximadamente entre el 93% y el 99% de la población musulmana. Entre ellos, entre el 55% y el 65% se adhiere al chiismo, mientras que entre el 35% y el 45% sigue el sunita. Esta división tiene sus raíces históricas en el pasado de la región, en particular durante la época en que partes de Azerbaiyán se integraron a Irán, una nación donde el chiismo es la religión oficial.
Azerbaiyán alberga tres importantes comunidades judías: los judíos de las montañas, los judíos asquenazíes y los judíos georgianos. En la capital, Bakú, así como en las ciudades de Guba y Oguz, existen seis sinagogas activas, además de diversos centros culturales y organizaciones religiosas judías. Cabe destacar que la sinagoga inaugurada en Bakú el 9 de marzo de 2003 es reconocida como una de las más grandes de Europa.
La historia del cristianismo en Azerbaiyán abarca casi 2,000 años y está estrechamente vinculada al apóstol Bartolomé, uno de los doce discípulos de Jesucristo. Se cree que predicó en la región, lo que le llevó al martirio en el año 71 d. C. cerca de la Torre de la Doncella, en la actual Bakú. Desde entonces, este lugar se ha convertido en un lugar sagrado para los cristianos.
En Azerbaiyán hay iglesias tanto ortodoxas como católicas. Actualmente, hay cinco iglesias ortodoxas en funcionamiento, entre ellas la Catedral de las Santas Mirras, la Iglesia de la Santísima Virgen María y la Iglesia del Arcángel Miguel, todas ellas situadas en Bakú. El catolicismo empezó a arraigarse en Azerbaiyán en el siglo XIV, tras la llegada de misioneros de diversas órdenes católicas, como los dominicos, los carmelitas y los franciscanos. La primera iglesia católica, la Iglesia de la Inmaculada Concepción de la Santísima Virgen María, se estableció a principios del siglo XX. En 14, Azerbaiyán tuvo el honor de recibir la visita del Papa Juan Pablo II. Hoy en día, la comunidad católica en Azerbaiyán es relativamente pequeña, compuesta por unas 20 personas. Además, hay aproximadamente 2002 pequeñas comunidades protestantes-bautistas en todo el país.