La ubicación de Tayikistán en la encrucijada de las zonas templadas y subtropicales ha dado lugar a una notable diversidad de flora y fauna. La vida vegetal prospera desde las cálidas tierras bajas hasta las frías cumbres de las montañas. La vegetación del desierto se transforma en estepas y praderas, y luego en frondosos bosques caducifolios. A lo largo de las riberas de los ríos se pueden encontrar matorrales de tugai, álamos y sauces, mientras que en otras regiones hay pistacheros, nogales y almendros de Bujará. En las regiones montañosas, predominan los arbustos y las plantas espinosas.
El reino animal es igualmente variado. En las tierras bajas deambulan ardillas terrestres, jerbos y gacelas, mientras que hienas y puercoespines habitan los valles fluviales. Los bosques son el hogar de lobos, zorros y osos, y las montañas son el dominio de leopardos de las nieves y ovejas salvajes.
Las montañas de Tayikistán se encuentran entre los lugares más pintorescos de la Tierra, y combinan algunas de las cadenas montañosas más altas de Eurasia con verdes praderas alpinas y ríos prístinos. En verano, las flores silvestres, como los lirios, las amapolas y las edelweiss, crean un vibrante tapiz en las laderas, mientras que las truchas de montaña en los caudalosos ríos son una codiciada captura para los pescadores. Las numerosas marmotas son presa de las águilas reales y los buitres barbudos, y el esquivo leopardo de las nieves acecha a las cabras salvajes y a las cabras montesas entre los riscos y las gargantas. Este impresionante mundo natural permanece en gran parte intacto por la mano de la civilización, ofreciendo una verdadera experiencia de naturaleza salvaje para quienes la buscan.