La mosquée Sheki Juma, construite entre 1900 et 1914 dans le quartier du cuir de Sheki, constitue un remarquable témoignage du patrimoine architectural et culturel de la région. Elle faisait partie d'un complexe plus vaste comprenant une madrasa (école islamique) et des bains souterrains, situés à proximité. Selon une inscription gravée dans la pierre, la construction de la mosquée fut achevée en 1914, coïncidant avec l'ajout d'une nouvelle aile, de cellules et d'un minaret. Par la suite, la madrasa fut construite à côté de la mosquée, créant ainsi un environnement éducatif et spirituel cohérent.
À l'époque soviétique, le bâtiment de la mosquée fut transformé en école de sport. Pour accueillir cette nouvelle fonction, le balcon intérieur de la salle de prière fut supprimé et le minaret subit d'importants dommages, entraînant sa destruction.
En 1988, la mosquée fut tragiquement la proie des flammes, affaiblissant encore davantage sa structure. Cependant, en 1989, une lueur d'espoir apparut grâce à des mesures précises et à la préparation d'un projet de restauration. Des fouilles dans la salle de prière révélèrent l'emplacement d'un mur intérieur adjacent à l'aile, ce qui imposa la restauration de ce mur et du balcon intérieur. Les fenêtres, auparavant murées, furent rouvertes et restaurées selon leurs dimensions d'origine, permettant à la lumière naturelle d'inonder à nouveau l'intérieur. Dans le cadre de ces travaux, quatre grandes colonnes furent intégrées au projet et le mihrab (niche de prière) de la mosquée fut méticuleusement restauré.
Le minaret de la mosquée a été reconstruit d'après une photographie historique retrouvée dans les archives. Il culmine à 28.5 mètres de hauteur, de sa base à son sommet. La restauration du minaret a été achevée en 1991, marquant ainsi une avancée majeure dans la préservation de l'intégrité historique de la mosquée.
À côté de la mosquée Juma se trouve le bain souterrain, ingénieusement encastré dans la colline.
