Да, временный ввоз автомобиля — 25 долларов или в сомони. Раньше для въезда в Кыргызстан со стороны Мургаба через туристический аэропорт также требовалось разрешение...
Судя по формулировке вопроса, вам определенно не стоит отправляться в одиночный поход к озеру Ала-Куль.