Память о Файзулле Ходжаеве до сих пор чтят в Бухаре, и превращение его семейного дома в музей является свидетельством его непреходящего наследия. Музей расположен в известном бухарском квартале Гозиён, районе, исторически населенном придворной знатью, богатыми купцами и торговцами. Убайдуллоходжа, отец Файзуллы, построил несколько домов в этом квартале в конце XIX века, наняв самых опытных бухарских архитекторов для создания образца жилой архитектуры.
Музей Файзуллы Ходжаева отличается роскошными и изысканными интерьерами. Комнаты украшены сложной резьбой по дереву и ганчем (вид штукатурки), демонстрируя мастерство того периода. В музее также хранится оригинальная посуда и мебель, когда-то принадлежавшие семье Ходжаевых, что дает возможность заглянуть в образ жизни элиты Бухары в XIX веке.
Как и многие богатые дома в Бухаре, дом Файзуллы Ходжаева имеет внутренний двор (хавли дарун) и внешний двор (хавли берун). В мусульманских домохозяйствах хавли дарун обычно был женской частью дома, в то время как хавли берун предназначался для мужчин. Имущество также включает в себя конюшни, сады и различные хозяйственные помещения.
Одним из самых интригующих аспектов дома является его сеть подземных туннелей. Назначение этих туннелей остается загадкой. Возможно, они были построены Убайдуллоходжей как средство спасения в случае опасности или недовольства хана, или они могли иметь гораздо более древнее происхождение, предшествующее строительству дома.