Tacikistan'ın ılıman ve subtropikal bölgelerin kesişim noktasındaki konumu, dikkate değer bir flora ve fauna çeşitliliğine yol açmıştır. Bitki örtüsü sıcak ovalardan soğuk dağ zirvelerine kadar gelişir. Çöl bitki örtüsü bozkırlara ve çayırlara ve ardından yemyeşil yaprak döken ormanlara dönüşür. Nehir kıyılarında tugai çalılıkları, kavaklar ve söğütler bulabilirsiniz; diğer bölgelerde ise fıstık ağaçları, ceviz bahçeleri ve Buhara bademleri bulunur. Dağlık bölgelerde çalılar ve dikenli bitkiler yaygındır.
Hayvanlar alemi de aynı şekilde çeşitlidir. Ovalarda sincaplar, jerboalar ve ceylanlar dolaşır, sırtlanlar ve kirpiler ise nehir vadilerinde yaşar. Ormanlar kurtlara, tilkilere ve ayılara ev sahipliği yapar ve dağlar kar leoparlarının ve yabani koyunların alanıdır.
Tacikistan'ın dağları, Avrasya'nın en yüksek sıradağlarından bazılarını yemyeşil alpin çayırları ve bozulmamış nehirlerle birleştiren Dünya'nın en güzel yerleri arasındadır. Yaz aylarında, süsen, gelincik ve edelweiss gibi yabani çiçekler yamaçlarda canlı bir goblen oluştururken, akan nehirlerdeki dağ alabalıkları balıkçılar için gözde bir avdır. Çok sayıda dağ sıçanı, altın kartallar ve sakallı akbabalar için av sağlar ve yakalanması zor kar leoparı, kayalıklar ve geçitler arasında yabani keçileri ve dağ keçilerini takip eder. Bu çarpıcı doğal dünya, medeniyetin elinden büyük ölçüde etkilenmemiş olarak kalır ve onu arayanlara gerçek bir vahşi yaşam deneyimi sunar.
